Nel gennaio 2006, la Forza internazionale di assistenza alla sicurezza (ISAF) è stata schierata in Afghanistan per assistere le forze armate statunitensi e britanniche nella lotta contro i talebani paramilitari islamisti. Il governo degli Stati Uniti ha accusato i talebani di ospitare il capo di al-Qaeda, Osama bin Laden, e ha chiesto la sua estradizione. La leadership talebana si è rifiutata di soddisfare questa richiesta, affermando che gli Stati Uniti non hanno fornito prove della colpevolezza di Osama negli attacchi dell'11 settembre 2001.
Alla fine del 2001, la struttura militare dei talebani è stata praticamente distrutta e la resistenza dei suoi sostenitori ha preso la forma di un movimento di guerriglia. I paesi occidentali hanno investito molto nello sviluppo della democrazia e della struttura sociale dell'Afghanistan. Nel 2004, la prima elezione presidenziale del paese è stata vinta da Hamid Karzai, un politico abbastanza fedele all'Occidente. Tuttavia, la resistenza dei sostenitori dei talebani non è stata soppressa. I guerriglieri combatterono ferocemente nonostante la schiacciante superiorità militare dell'ISAF.
La Francia, come altri membri dell'alleanza, ha subito perdite di attrezzature e manodopera. Durante i 10 anni di guerra in Afghanistan, 83 soldati sono stati uccisi e molte volte feriti. La decisione di coinvolgere la Francia nell'operazione militare non era molto popolare tra la popolazione e le notizie di vittime tra i soldati francesi aumentavano il malcontento nei confronti del governo.
Il 20 gennaio 2012, nella provincia di Kapisa, un uomo in uniforme dell'esercito afghano ha sparato a 4 colpi e ha ferito 16 soldati francesi. Successivamente, Nicolas Sarkozy (presidente francese dal 2007 al 2012) ha affermato che poiché il governo afghano non può garantire la sicurezza delle truppe francesi, la Francia sospende la sua presenza militare in quel paese. Sarkozy ha promesso di ritirare le truppe dall'Afghanistan entro l'inizio del 2014.
Nel 2012, François Hollande è stato eletto presidente della Francia, che ha annunciato un nuovo piano per il ritiro dall'Afghanistan. Entro la fine del 2012 verranno ritirati 2.000 militari, 1.400 rimangono come istruttori ea guardia delle strutture sociali. Il presidente ha spiegato la sua decisione con il fatto che il pericolo dei terroristi è diminuito, la democrazia si è rafforzata e il paese deve svilupparsi in modo indipendente. Il capo della repubblica ha promesso che la Francia avrebbe continuato a sostenere l'Afghanistan, ma in una forma diversa.
